1996年起加入香港中文大学管理学系，教授企业战略管理、在中国环境下的战略管理等课程。

主要研究领域：企业战略和组织管理方面，包括中小企业国际化，可持续发展战略，制度构建，战略传承和组织话语分析等课题。 

在组织科学，国际商业研究杂志等国际著名刊物上发表多篇论文，并著有《中国企业的管理决策过程》等专著。

吕源教授在1999年至2005年担任《Human Relations》国际编委，2007年和2011年两度担任《Asia Pacific Journal of Management》特刊的客座编辑。